В почвообразовании участвуют три группы организмов – зеленые растения, микроорганизмы и животные, образующие на суше сложные биоценозы. При совместном воздействии организмов в процессе их жизнедеятельности, а также за счет продуктов жизнедеятельности осуществляются важнейшие звенья почвообразования – синтез и разрушение органического вещества, избирательная концентрация биологически важных элементов, разрушение и новообразование минералов, миграция и аккумуляция веществ и другие явления, составляющие сущность почвообразовательного процесса и определяющие формирование главного свойства почвы – плодородия.
Вместе с тем функции каждой из этих групп как почвообразователей различны.
Низшие организмы (грибы и бактерии) вызывают разложение растительных остатков, а также различных минералов, в том числе даже такого устойчивого, как кварц. В процессе разложения органических остатков зольные вещества высвобождаются и могут быть вновь усвоены растениями. Одновременно образуются свободные органические кислоты, которые принимают участие в разрушении частиц и минералов и миграции в почвенном профиле минеральных окислов (особенно окислов алюминия и железа).
Азотфиксирующие микроорганизмы способствуют накоплению в почве азота в форме органических соединений.
Нитрифицирующие, аммонифицирующие бактерии образуют минеральные формы азота, усвояемые высшими растениями.
Взаимосвязь между растительными формациями, направлением почвообразовательного процесса и закономерностью пространственного распределения почвенного покрова отчетливо прослеживается на самых различных уровнях.
Большое влияние на почвообразовательные процессы оказывают многочисленные представители почвенной фауны – беспозвоночные и позвоночные, населяющие различные горизонты почвы и живущие на ее поверхности.
По размерам особей представителей почвенной фауны разделяют на четыре группы (G. Bachelier, 1963):
1) микрофауна – организмы размером менее 0,2 мм; это протозоа, нематоды, ризоподы, живущие во влажной почвенной среде;
2) мезофауна – животные, размеры которых изменяются от 0,2 до 4 мм – микроартроподы, мельчайшие насекомые, мириаподы, специфические черви;
3) макрофауна – животные, имеющие размеры от 4 до 80 мм; это земляные черви, моллюски, насекомые (муравьи, термиты и др.);
4) мегафауна – размер животных более 80 мм; к ним относятся крупные насекомые, крабы, скорпионы, кроты, змеи, черепахи, мелкие и крупные грызуны, лисы, барсуки и другие животные, делающие в почве ходы и норы.
Растительность, местный климат, почвы, животные и микроорганизмы, населяющие почву, локальные условия рельефа, горные породы, поверхностные и грунтовые воды определенного ландшафта образуют сложную экологическую систему, в которой почвы являются важнейшим компонентом.